MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II plasmid pBD-II

Total Repeats: 1084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017476	A	6	6	29	34	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017476	GCC	2	6	35	40	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017476	CAG	2	6	52	57	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017476	TGA	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017476	CCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824841
6	NC_017476	ACC	2	6	459	464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017476	TAA	2	6	506	511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017476	TAT	2	6	512	517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017476	GAG	2	6	618	623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017476	TAC	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017476	GTC	2	6	667	672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017476	ACC	2	6	716	721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017476	ATG	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824842
14	NC_017476	TGC	3	9	850	858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824842
15	NC_017476	T	7	7	861	867	0 %	100 %	0 %	0 %	385824842
16	NC_017476	ACC	2	6	944	949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824842
17	NC_017476	GTT	2	6	1003	1008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824842
18	NC_017476	TG	3	6	1094	1099	0 %	50 %	50 %	0 %	385824842
19	NC_017476	CTGC	2	8	1233	1240	0 %	25 %	25 %	50 %	385824842
20	NC_017476	GCA	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824842
21	NC_017476	AAAT	2	8	1427	1434	75 %	25 %	0 %	0 %	385824842
22	NC_017476	ACGTG	2	10	1482	1491	20 %	20 %	40 %	20 %	385824842
23	NC_017476	TTG	2	6	1732	1737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824842
24	NC_017476	CGT	2	6	1792	1797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824842
25	NC_017476	GCTC	2	8	1883	1890	0 %	25 %	25 %	50 %	385824842
26	NC_017476	CTG	2	6	1931	1936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824842
27	NC_017476	TGC	2	6	1949	1954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824842
28	NC_017476	CCA	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824842
29	NC_017476	TTC	2	6	2006	2011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824842
30	NC_017476	TGTT	2	8	2156	2163	0 %	75 %	25 %	0 %	385824842
31	NC_017476	A	6	6	2196	2201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017476	ATG	3	9	2232	2240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
33	NC_017476	TCC	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824843
34	NC_017476	TTG	2	6	2311	2316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
35	NC_017476	ATG	2	6	2320	2325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
36	NC_017476	TGC	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824843
37	NC_017476	TGA	2	6	2378	2383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
38	NC_017476	TTC	2	6	2394	2399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824843
39	NC_017476	AGT	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
40	NC_017476	CGG	2	6	2444	2449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824843
41	NC_017476	AAT	2	6	2529	2534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824843
42	NC_017476	GGT	2	6	2583	2588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824843
43	NC_017476	CTG	2	6	2616	2621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824843
44	NC_017476	GTT	2	6	2647	2652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
45	NC_017476	TGAC	2	8	2667	2674	25 %	25 %	25 %	25 %	385824843
46	NC_017476	AT	3	6	2749	2754	50 %	50 %	0 %	0 %	385824843
47	NC_017476	AACT	2	8	2837	2844	50 %	25 %	0 %	25 %	385824843
48	NC_017476	GAG	2	6	3035	3040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385824843
49	NC_017476	GATCAA	2	12	3071	3082	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385824843
50	NC_017476	CAC	2	6	3101	3106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824843
51	NC_017476	TGAT	2	8	3135	3142	25 %	50 %	25 %	0 %	385824843
52	NC_017476	GTA	2	6	3153	3158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
53	NC_017476	TCA	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
54	NC_017476	CTTTG	2	10	3387	3396	0 %	60 %	20 %	20 %	385824843
55	NC_017476	TCAT	2	8	3421	3428	25 %	50 %	0 %	25 %	385824843
56	NC_017476	TAGTT	2	10	3430	3439	20 %	60 %	20 %	0 %	385824843
57	NC_017476	CAT	2	6	3479	3484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
58	NC_017476	CAT	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
59	NC_017476	GCA	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824843
60	NC_017476	ATC	2	6	3561	3566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
61	NC_017476	CA	3	6	3575	3580	50 %	0 %	0 %	50 %	385824843
62	NC_017476	CAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
63	NC_017476	GTT	2	6	3614	3619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
64	NC_017476	CAG	2	6	3635	3640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824843
65	NC_017476	GTT	2	6	3643	3648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
66	NC_017476	GCT	2	6	3707	3712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824843
67	NC_017476	CAA	2	6	3815	3820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824843
68	NC_017476	CG	3	6	3843	3848	0 %	0 %	50 %	50 %	385824843
69	NC_017476	T	7	7	3886	3892	0 %	100 %	0 %	0 %	385824843
70	NC_017476	GTT	2	6	3896	3901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
71	NC_017476	GGCT	2	8	3985	3992	0 %	25 %	50 %	25 %	385824843
72	NC_017476	GTC	2	6	4009	4014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824843
73	NC_017476	GGT	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824843
74	NC_017476	TGAT	2	8	4197	4204	25 %	50 %	25 %	0 %	385824843
75	NC_017476	ACC	2	6	4230	4235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824843
76	NC_017476	CAGC	2	8	4274	4281	25 %	0 %	25 %	50 %	385824843
77	NC_017476	ATG	2	6	4295	4300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
78	NC_017476	AATG	2	8	4316	4323	50 %	25 %	25 %	0 %	385824843
79	NC_017476	AAT	2	6	4362	4367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824843
80	NC_017476	GGC	2	6	4377	4382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824843
81	NC_017476	ACC	2	6	4430	4435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824844
82	NC_017476	GAC	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824844
83	NC_017476	GCA	2	6	4467	4472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824844
84	NC_017476	TCA	2	6	4499	4504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824844
85	NC_017476	GC	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017476	CTT	2	6	4757	4762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017476	T	6	6	4885	4890	0 %	100 %	0 %	0 %	385824845
88	NC_017476	TTTTG	2	10	4974	4983	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017476	TCG	2	6	5127	5132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824846
90	NC_017476	TTCT	2	8	5150	5157	0 %	75 %	0 %	25 %	385824846
91	NC_017476	ATC	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824846
92	NC_017476	CGG	2	6	5231	5236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824846
93	NC_017476	CAA	2	6	5391	5396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017476	TTGC	2	8	5422	5429	0 %	50 %	25 %	25 %	385824847
95	NC_017476	T	7	7	5444	5450	0 %	100 %	0 %	0 %	385824847
96	NC_017476	T	6	6	5491	5496	0 %	100 %	0 %	0 %	385824847
97	NC_017476	CGG	2	6	5563	5568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824847
98	NC_017476	TGGAT	2	10	5569	5578	20 %	40 %	40 %	0 %	385824847
99	NC_017476	T	6	6	5831	5836	0 %	100 %	0 %	0 %	385824847
100	NC_017476	GCT	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824847
101	NC_017476	TG	3	6	5964	5969	0 %	50 %	50 %	0 %	385824847
102	NC_017476	CAC	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824847
103	NC_017476	CT	3	6	6039	6044	0 %	50 %	0 %	50 %	385824847
104	NC_017476	CT	3	6	6079	6084	0 %	50 %	0 %	50 %	385824847
105	NC_017476	CAC	2	6	6100	6105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824847
106	NC_017476	TG	3	6	6167	6172	0 %	50 %	50 %	0 %	385824847
107	NC_017476	CAA	2	6	6181	6186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824847
108	NC_017476	TGA	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824847
109	NC_017476	TGA	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824847
110	NC_017476	AGA	2	6	6289	6294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824847
111	NC_017476	TGG	2	6	6344	6349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824847
112	NC_017476	GTT	2	6	6406	6411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824848
113	NC_017476	GTT	2	6	6486	6491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824848
114	NC_017476	T	6	6	6594	6599	0 %	100 %	0 %	0 %	385824848
115	NC_017476	GCT	2	6	6669	6674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824848
116	NC_017476	TCAGC	2	10	6681	6690	20 %	20 %	20 %	40 %	385824848
117	NC_017476	TTGGC	2	10	6731	6740	0 %	40 %	40 %	20 %	385824848
118	NC_017476	AAT	2	6	6786	6791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824848
119	NC_017476	CTT	2	6	6946	6951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824848
120	NC_017476	CAAA	2	8	7008	7015	75 %	0 %	0 %	25 %	385824848
121	NC_017476	A	6	6	7013	7018	100 %	0 %	0 %	0 %	385824848
122	NC_017476	TAT	2	6	7027	7032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824848
123	NC_017476	T	6	6	7126	7131	0 %	100 %	0 %	0 %	385824848
124	NC_017476	GCC	2	6	7181	7186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824848
125	NC_017476	TGG	2	6	7258	7263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017476	CAT	2	6	7446	7451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017476	T	6	6	7525	7530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017476	CCT	2	6	7547	7552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017476	CAT	3	9	7567	7575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824849
130	NC_017476	TCA	2	6	7594	7599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824849
131	NC_017476	CTT	2	6	7604	7609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824849
132	NC_017476	T	6	6	7608	7613	0 %	100 %	0 %	0 %	385824849
133	NC_017476	AAC	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824849
134	NC_017476	GTT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824849
135	NC_017476	T	7	7	7729	7735	0 %	100 %	0 %	0 %	385824849
136	NC_017476	GCT	2	6	7736	7741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824849
137	NC_017476	ATT	2	6	7804	7809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824849
138	NC_017476	TTA	2	6	7820	7825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824850
139	NC_017476	TGAT	2	8	7841	7848	25 %	50 %	25 %	0 %	385824850
140	NC_017476	TGC	2	6	7881	7886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824850
141	NC_017476	GCA	2	6	7900	7905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824850
142	NC_017476	GGT	2	6	8067	8072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824850
143	NC_017476	TTG	2	6	8129	8134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824850
144	NC_017476	T	6	6	8190	8195	0 %	100 %	0 %	0 %	385824850
145	NC_017476	TTA	2	6	8293	8298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824850
146	NC_017476	TCC	2	6	8353	8358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_017476	TGC	2	6	8425	8430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824851
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149	NC_017476	GA	3	6	8450	8455	50 %	0 %	50 %	0 %	385824851
150	NC_017476	CTGC	2	8	8519	8526	0 %	25 %	25 %	50 %	385824851
151	NC_017476	ACCA	2	8	8532	8539	50 %	0 %	0 %	50 %	385824851
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158	NC_017476	TTG	2	6	8776	8781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824851
159	NC_017476	GGC	2	6	8844	8849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824851
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243	NC_017476	GT	3	6	12592	12597	0 %	50 %	50 %	0 %	385824852
244	NC_017476	AC	3	6	12639	12644	50 %	0 %	0 %	50 %	385824852
245	NC_017476	TGA	2	6	12719	12724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824852
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248	NC_017476	TCATC	2	10	12867	12876	20 %	40 %	0 %	40 %	385824852
249	NC_017476	ATC	2	6	12892	12897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824852
250	NC_017476	TGA	2	6	12954	12959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824852
251	NC_017476	TGA	2	6	13031	13036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824852
252	NC_017476	A	6	6	13086	13091	100 %	0 %	0 %	0 %	385824852
253	NC_017476	CTTG	2	8	13182	13189	0 %	50 %	25 %	25 %	385824852
254	NC_017476	AAC	2	6	13214	13219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824852
255	NC_017476	TCT	2	6	13242	13247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824852
256	NC_017476	TTG	2	6	13331	13336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_017476	GAT	2	6	13346	13351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_017476	ACTC	2	8	13608	13615	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
259	NC_017476	TGT	2	6	13630	13635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824853
260	NC_017476	GTTT	2	8	13654	13661	0 %	75 %	25 %	0 %	385824853
261	NC_017476	TAG	2	6	13678	13683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824853
262	NC_017476	ATG	2	6	13701	13706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824853
263	NC_017476	GAA	2	6	13828	13833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824853
264	NC_017476	ATG	2	6	13858	13863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824853
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266	NC_017476	CCGG	2	8	13921	13928	0 %	0 %	50 %	50 %	385824853
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400	NC_017476	ACC	2	6	20353	20358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824862
401	NC_017476	CGA	2	6	20466	20471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824862
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499	NC_017476	TCAA	2	8	25416	25423	50 %	25 %	0 %	25 %	385824869
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